Jared Simpson

@jaredtsimpson

Computational Biologist. Principal Investigator at OICR & Assistant Professor .

simpsonlab.github.io
Дата приєднання: вересень 2009
7 фото та відео Фото і відео

Твіти

Ви заблокували @jaredtsimpson

Ви впевнені, що хочете переглянути ці твіти? Перегляд твітів не розблокує профіль @jaredtsimpson

  1. ретвітнув(ла)
    4 груд.

    Our preprint introducing >300 Gbp sequencing of microbial community standards is up! Of interest to anyone looking for juicy real data to put tools to the test. Amazing lab work & nice first paper with lab

    86 ретвітів 174 вподобань
    Скасувати
  2. ретвітнув(ла)
    28 лист.

    Now available from : and with colleagues including and measured over 1,000,000,000 Cas9 editing outcomes, and thoroughly dissected the data. 1/

    49 ретвітів 94 вподобань
    Показати цей потік
    Показати цей потік
    Скасувати
  3. ретвітнув(ла)
    28 лист.

    lab with a beautiful paper:

    3 ретвіти 1 вподобання
    Скасувати
  4. ретвітнув(ла)
    26 лист.

    High-Throughput Biology: From Sequence to Networks, 6-day course w/. Applications due 1/15. Instructors:

    18 ретвітів 28 вподобань
    Скасувати
  5. ретвітнув(ла)
    12 лист.

    Announcing a first release of methplotlib: a genome browser for methylation data from nanopolish by . Feedback and contributions more than welcome!

    98 ретвітів 165 вподобань
    Показати цей потік
    Показати цей потік
    Скасувати
  6. ретвітнув(ла)
    23 жовт.

    Interested in a long-read assembler with the speed of miniasm and comparable consensus accuracy of canu? Try wtdbg2 by my friend Jue Ruan. A human genome in one day. Also available from bioconda.

    211 ретвітів 342 вподобань
    Скасувати
  7. ретвітнув(ла)
    21 жовт.

    TT position available at U of Toronto in genomics and statistical genetics. Great community and colleagues here in Toronto. Potential opportunities for a link with . Please RT

    1 reply 56 ретвітів 28 вподобань
    Показати цей потік
    Показати цей потік
    Скасувати
  8. ретвітнув(ла)
    18 жовт.

    I think this'll be our best promethion run so far! It just blew past 75Gb in 24hours with >2100 pores still sequencing and >96% pore occupancy

    1 reply 18 ретвітів 38 вподобань
    Скасувати
  9. ретвітнув(ла)
    18 жовт.

    Sooo good! Using long-read sequencing to detect imprinted DNA methylation

    9 ретвітів 14 вподобань
    Скасувати
  10. ретвітнув(ла)
    16 жовт.

    D-NAscent: dynamics by sequencing reveals on single-molecules replication origins, fork direction & fork pausing. Great collaboration

    34 ретвіти 53 вподобань
    Скасувати
  11. 16 жовт.

    We just posted a preprint on measuring genome replication by detecting nucleotide analogues incorporated into the yeast genome using signals. Work led by , and .

    1 reply 34 ретвіти 54 вподобань
    Скасувати
  12. ретвітнув(ла)
    15 жовт.

    Never imagined that the malloc in glibc affects the multithreaded performance by this much! :o Impact of malloc on call-methylation performance ...

    12 ретвітів 29 вподобань
    Скасувати
  13. 11 вер.

    New nanopolish release (0.10.2) containing the first public version of our poly-A tail length estimator for direct RNA reads: . Developed by Paul Tang in my group.

    90 ретвітів 158 вподобань
    Скасувати
  14. ретвітнув(ла)
    3 серп.

    130.6 Gb from our first PromethION flowcell... The most exciting moment was realising we still had 7000 pores after 64 hours so fuelled it up and kicked it off again!

    54 ретвіти 159 вподобань
    Скасувати
  15. 25 лип.

    nanopolish v0.10.1 released: this version changes the interface of the consensus polishing workflow so some pipelines may need to be updated. See the release notes here:

    1 reply 69 ретвітів 106 вподобань
    Скасувати
  16. ретвітнув(ла)
    24 лип.

    Slides from my talk on "k-mer Data Structures" at :

    38 ретвітів 90 вподобань
    Скасувати
  17. ретвітнув(ла)
    20 лип.

    Received a nice NanoPlot feature suggestion from : evolution of sequencing speed across time. Here is an example of one of our PromethION runs. Available in v1.15.0 from PyPI

    12 ретвітів 36 вподобань
    Скасувати
  18. ретвітнув(ла)
    20 лип.

    Come work with us and help build the foundation for a Canadian approach to national genomics research!

    Backend Developer - CanDIG -
    1 reply 3 ретвіти 7 вподобань
    Показати цей потік
    Показати цей потік
    Скасувати
  19. ретвітнув(ла)
    8 лип.

    Week end fun : Ecoli consensus and chr22 methylation detection using on my mobile phone for some reads (Includes minimap2 and samtools).

    14 ретвітів 29 вподобань
    Скасувати
  20. ретвітнув(ла)
    5 лип.

    Meet us at : talks on diploid assembly () and on using Strand-seq to sort long reads by chromosome prior to assembly (). Two posters: sequence-to-graph alignment and haplotype phasing. Also, we are LOOKING FOR POSTDOCS.

    1 reply 16 ретвітів 28 вподобань
    Скасувати

@jaredtsimpson ще нічого не твітив(ла).

Схоже, завантаження займе трохи часу.

Можливо, Твіттер перенавантажено або виникли тимчасові труднощі. Спробуйте ще раз або дізнайтеся більше про стан Твіттера.

    Вам також може сподобатись

    ·