Jared Simpson

@jaredtsimpson

Computational Biologist. Principal Investigator at OICR & Assistant Professor .

simpsonlab.github.io
در ۱۳۸۸ شهریور پیوسته است
۷ عکس و ویدیوی جدید تصاویر و ویدیوها

توييت‌ها

@jaredtsimpson را مسدود کردید

مطمئن اید که می‌خواهید این توییت‌ها را ببینید؟ دیدن توییت‌ها، @jaredtsimpson را از مسدودشدگی در نمی‌آورد.

  1. بازتوییت کرد
    آذر ۱۳

    Our preprint introducing >300 Gbp sequencing of microbial community standards is up! Of interest to anyone looking for juicy real data to put tools to the test. Amazing lab work & nice first paper with lab

    ۴ پاسخ‌ها ۸۶بازتوییت ۱۷۴ پسندیدن
    بازگرداندن
  2. بازتوییت کرد
    آذر ۷

    Now available from : and with colleagues including and measured over 1,000,000,000 Cas9 editing outcomes, and thoroughly dissected the data. 1/

    ۵ پاسخ‌ها ۴۹بازتوییت ۹۴ پسندیدن
    نمایش این رشته‌توییت
    نمایش این رشته‌توییت
    بازگرداندن
  3. بازتوییت کرد
    آذر ۷

    lab with a beautiful paper:

    ۳بازتوییت ۱پسندیدن
    بازگرداندن
  4. بازتوییت کرد
    آذر ۵

    High-Throughput Biology: From Sequence to Networks, 6-day course w/. Applications due 1/15. Instructors:

    ۱۸بازتوییت ۲۸ پسندیدن
    بازگرداندن
  5. بازتوییت کرد
    آبان ۲۱

    Announcing a first release of methplotlib: a genome browser for methylation data from nanopolish by . Feedback and contributions more than welcome!

    ۳ پاسخ‌ها ۹۸بازتوییت ۱۶۵ پسندیدن
    نمایش این رشته‌توییت
    نمایش این رشته‌توییت
    بازگرداندن
  6. بازتوییت کرد
    آبان ۱

    Interested in a long-read assembler with the speed of miniasm and comparable consensus accuracy of canu? Try wtdbg2 by my friend Jue Ruan. A human genome in one day. Also available from bioconda.

    ۹ پاسخ‌ها ۲۱۱بازتوییت ۳۴۲ پسندیدن
    بازگرداندن
  7. بازتوییت کرد
    مهر ۲۹

    TT position available at U of Toronto in genomics and statistical genetics. Great community and colleagues here in Toronto. Potential opportunities for a link with . Please RT

    ۱ پاسخ ۵۶بازتوییت ۲۸ پسندیدن
    نمایش این رشته‌توییت
    نمایش این رشته‌توییت
    بازگرداندن
  8. بازتوییت کرد
    مهر ۲۶

    I think this'll be our best promethion run so far! It just blew past 75Gb in 24hours with >2100 pores still sequencing and >96% pore occupancy

    ۱ پاسخ ۱۸بازتوییت ۳۸ پسندیدن
    بازگرداندن
  9. بازتوییت کرد
    مهر ۲۶

    Sooo good! Using long-read sequencing to detect imprinted DNA methylation

    ۹بازتوییت ۱۴ پسندیدن
    بازگرداندن
  10. بازتوییت کرد
    مهر ۲۴

    D-NAscent: dynamics by sequencing reveals on single-molecules replication origins, fork direction & fork pausing. Great collaboration

    ۳ پاسخ‌ها ۳۴بازتوییت ۵۳ پسندیدن
    بازگرداندن
  11. مهر ۲۴

    We just posted a preprint on measuring genome replication by detecting nucleotide analogues incorporated into the yeast genome using signals. Work led by , and .

    ۱ پاسخ ۳۴بازتوییت ۵۴ پسندیدن
    بازگرداندن
  12. بازتوییت کرد
    مهر ۲۳

    Never imagined that the malloc in glibc affects the multithreaded performance by this much! :o Impact of malloc on call-methylation performance ...

    ۳ پاسخ‌ها ۱۲بازتوییت ۲۹ پسندیدن
    بازگرداندن
  13. شهریور ۲۰

    New nanopolish release (0.10.2) containing the first public version of our poly-A tail length estimator for direct RNA reads: . Developed by Paul Tang in my group.

    ۳ پاسخ‌ها ۹۰بازتوییت ۱۵۸ پسندیدن
    بازگرداندن
  14. بازتوییت کرد
    مرداد ۱۲

    130.6 Gb from our first PromethION flowcell... The most exciting moment was realising we still had 7000 pores after 64 hours so fuelled it up and kicked it off again!

    ۱۵ پاسخ‌ها ۵۴بازتوییت ۱۵۹ پسندیدن
    بازگرداندن
  15. مرداد ۳

    nanopolish v0.10.1 released: this version changes the interface of the consensus polishing workflow so some pipelines may need to be updated. See the release notes here:

    ۱ پاسخ ۶۹بازتوییت ۱۰۶ پسندیدن
    بازگرداندن
  16. بازتوییت کرد
    مرداد ۲

    Slides from my talk on "k-mer Data Structures" at :

    ۲ پاسخ‌ها ۳۸بازتوییت ۹۰ پسندیدن
    بازگرداندن
  17. بازتوییت کرد
    تیر ۲۹

    Received a nice NanoPlot feature suggestion from : evolution of sequencing speed across time. Here is an example of one of our PromethION runs. Available in v1.15.0 from PyPI

    ۱۲بازتوییت ۳۶ پسندیدن
    بازگرداندن
  18. بازتوییت کرد
    تیر ۲۹

    Come work with us and help build the foundation for a Canadian approach to national genomics research!

    Backend Developer - CanDIG -
    ۱ پاسخ ۳بازتوییت ۷ پسندیدن
    نمایش این رشته‌توییت
    نمایش این رشته‌توییت
    بازگرداندن
  19. بازتوییت کرد
    تیر ۱۷

    Week end fun : Ecoli consensus and chr22 methylation detection using on my mobile phone for some reads (Includes minimap2 and samtools).

    ۲ پاسخ‌ها ۱۴بازتوییت ۲۹ پسندیدن
    بازگرداندن
  20. بازتوییت کرد
    تیر ۱۴

    Meet us at : talks on diploid assembly () and on using Strand-seq to sort long reads by chromosome prior to assembly (). Two posters: sequence-to-graph alignment and haplotype phasing. Also, we are LOOKING FOR POSTDOCS.

    ۱ پاسخ ۱۶بازتوییت ۲۸ پسندیدن
    بازگرداندن

@jaredtsimpson هنوز توییتی نفرستاده است.

به‌نظر می‌رسد بارگزاری صفحه طول کشیده است.

ممکن است ظرفیت توییتر پر باشد یا موقتاً دچار مشکلی شده باشد. دوباره امتحان کنید یا برای اطلاعات بیشتر از وضعیت توییتر بازدید کنید.

    ممکن است این را هم بپسندید

    ·