Twitter | ಹುಡುಕು | |
Jared Simpson
Computational Biologist. Principal Investigator at OICR & Assistant Professor .
2,104
ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳು
1,326
ಹಿಂಬಾಲಿಸುತ್ತಿರುವವರು
5,830
ಹಿಂಬಾಲಕರು
ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳು
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Sam Nicholls ಡಿಸೆಂ 4
Our preprint introducing >300 Gbp sequencing of microbial community standards is up! Of interest to anyone looking for juicy real data to put tools to the test. Amazing lab work & nice first paper with lab
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಡಿಸೆಂ 1
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @michaelhoffman @ianholmes ಮತ್ತು 2 ಇತರರು
too late! I’ve just landed back in Toronto
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ನವೆಂ 30
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @RyanZiels @hans_j_jansen @DrT1973
the signals from the pores are different, so they complement each other
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ನವೆಂ 29
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @Psy_Fer_
didn’t make it to blue bottle then?
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Leopold Parts ನವೆಂ 28
Now available from : and with colleagues including and measured over 1,000,000,000 Cas9 editing outcomes, and thoroughly dissected the data. 1/
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Andy Fraser ನವೆಂ 28
lab with a beautiful paper:
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Michael Hoffman ನವೆಂ 26
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ನವೆಂ 12
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @wouter_decoster @nanopore
this is great - we wanted a set of tools exactly like this!
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Wouter De Coster ನವೆಂ 12
Announcing a first release of methplotlib: a genome browser for methylation data from nanopolish by . Feedback and contributions more than welcome!
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ನವೆಂ 9
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @ianholmes @3rdreviewer @JJ_Emerson
yeah I thought about trying to output a consensus quality but would have to find a way to represent indel error qualities
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ನವೆಂ 6
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @arnsbr @dundeeuni
congrats!
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Heng Li ಅಕ್ಟೋ 23
Interested in a long-read assembler with the speed of miniasm and comparable consensus accuracy of canu? Try wtdbg2 by my friend Jue Ruan. A human genome in one day. Also available from bioconda.
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Quaid Morris ಅಕ್ಟೋ 21
TT position available at U of Toronto in genomics and statistical genetics. Great community and colleagues here in Toronto. Potential opportunities for a link with . Please RT
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Fil Zuzarte ಅಕ್ಟೋ 18
I think this'll be our best promethion run so far! It just blew past 75Gb in 24hours with >2100 pores still sequencing and >96% pore occupancy
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Martin A. Smith ಅಕ್ಟೋ 18
Sooo good! Using long-read sequencing to detect imprinted DNA methylation
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಅಕ್ಟೋ 17
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @lh3lh3 @wouter_decoster
by . Accession IDs are in the paper
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
DNA Replication Lab ಅಕ್ಟೋ 16
D-NAscent: dynamics by sequencing reveals on single-molecules replication origins, fork direction & fork pausing. Great collaboration
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಅಕ್ಟೋ 16
We just posted a preprint on measuring genome replication by detecting nucleotide analogues incorporated into the yeast genome using signals. Work led by , and .
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಅಕ್ಟೋ 15
ಇವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ @lh3lh3 @nomad421 ಮತ್ತು 2 ಇತರರು
Back when I was in games development pre-allocation with custom allocators was standard. Some of my assemblers used that strategy too
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ
Jared Simpson ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
Hasindu Gamaarachchi ಅಕ್ಟೋ 15
Never imagined that the malloc in glibc affects the multithreaded performance by this much! :o Impact of malloc on call-methylation performance ...
Reply Retweet ಇಷ್ಟಪಡಿ