Gunnar Rätsch

@gxr

I love large biomedical data

Zurich, Switzerland
ratschlab.org
ಏಪ್ರಿಲ್ 2009 ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸೇರಿದ್ದಾರೆ
26 ಫೋಟೋಗಳು ಅಥವಾ ವೀಡಿಯೋಗಳು ಫೋಟೋಗಳು ಮತ್ತು ವೀಡಿಯೋಗಳು

ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳು

ನೀವು @gxr ಅವರನ್ನು ತಡೆಹಿಡಿದಿರುವಿರಿ

ಈ ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು ನೀವು ಖಚಿತವಾಗಿ ಬಯಸುವಿರಾ? ಟ್ವೀಟ್ ವೀಕ್ಷಣೆಯು @gxr ಅವರ ತಡೆತೆರವುಗೊಳಿಸುವುದಿಲ್ಲ

  1. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 19

    Check out our group's contributions to :

    1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 5ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  2. ಡಿಸೆಂ 17

    Another year of HitSeq, please submit your papers until January 28th.

    7 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 4ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  3. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 15

    For reference, Kenna (more than anyone else) made the Cancer Genome Atlas useful. Not by siloing or embargoing data but by distributing it as widely and completely as possible.

    Possibly the two words that together are the most destructive to scientific progress: "my data."
    2 replies 2 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 11ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  4. ಡಿಸೆಂ 10

    Great work, Natalie. Congrats on your achievements and for defending your thesis!

    Fantastic thesis defense by from the lab! Congrats Natalie!!!
    1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 8ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  5. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 8

    My colleague Matthias Hüser just spoke about work from our lab () on learning unsupervised representations of ICU time series at . More info at the poster session!

    1 reply 2 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 11ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  6. ಡಿಸೆಂ 8

    We usually *do* think about causality, but in many cases we can only generate hypotheses based on associations that then need further validation. In biology one can design experiments for that. In medicine studies. This is done, but takes effort...

    on association-finding being "safer" than making causal statements, says if we are doing data science to aid in *decision-making*, we need to think about causal effects and not associations
    3ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  7. ಡಿಸೆಂ 8

    Contamination with germline is another issue. Assume these are confirmed somatic variants, then there is no inheritence. Hence this data should be handled as other physiological data.

    @gxr ಅವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ
    Well, within any set of somatic variants you have a subset of germline variants and the full identification would require sequencing normal tissues, which is not at all routine... so I would consider somatic vatiants as data to be protected in general.
    1 reply 1 ಇಷ್ಟ
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  8. ಡಿಸೆಂ 7

    Yes. But same would apply to heart rate or other phys. measurements, which are not as protected as genetic data. I see point of properly protecting germline variants bc of inheritence, but this is different for somatic variants. Better and more explicit regulations are needed...

    @gxr ಅವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ
    Conservative answer: yes absolutely. Scientific answer: it depends on the number of patient-centric variants you disclose, for N~1 the risk is ~null -anonymity. Now the naked truth: nobody ever died from a , while VUS are mass killers... and new regulations are needed.
    1 reply 1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 2ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  9. ಡಿಸೆಂ 7

    Xinrui Lyu, Matthias Hüser et al will present new work on unsupervised representation learning of time series at tomorrow at . We show how to better unsupervisedly learn representations of patient states predictive of future outcomes.

    1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 8ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  10. ಡಿಸೆಂ 7

    I wonder what the status of *somatic* mutations is w.r.t. GDPR. In many countries somatic mutations can be shared publicly. Does it fall under the broad category of genetic data in GDPR that needs special protection?

    I'm a coauthor on this month's GDPR Primer 'What specific protections apply to health-related, genetic, or biometric data?' The primers provide brief overviews of GDPR issues of interest to the genomics community:
    1 reply 1 ಇಷ್ಟ
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  11. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 6

    Machine Learning scientists founded the ELLIS society today at and in Montreal. Industry, science organizations and top researchers in the field are . Full story: and German press:

    5 replies 110 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 227ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  12. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 5

    Delighted to announce that today we've reached our milestone – we've hit 100,000! 🎉 We want to give a very public to all the individuals and organisations involved as we look ahead to taking medicine mainstream

    , , ಮತ್ತು 4 ಇತರರು
    53 replies 791 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 1,423ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  13. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 4

    I'm in Montreal for !

    2 replies 2 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 3ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  14. ಡಿಸೆಂ 3

    Congrats, Stephanie, excellent work!

    Great dissertation defense done by in the lab! Congrats Stephanie!!
    4 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 14ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  15. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಡಿಸೆಂ 2

    at , looking for a , and interested in ? the biomedical informatics group at ETH Zurich is hiring! send me a DM, or find me or my supervisor Gunnar Rätsch () in Montreal this week! more info:

    1 reply 11 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 23ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  16. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ನವೆಂ 30

    Need something to read on the flight to ? Check out the importance of unbiased, fair and reproducible experiments in our study “Challenging Common Assumptions in the Unsupervised Learning of Disentangled Representations”.

    2 replies 33 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 90ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  17. ನವೆಂ 28

    Combining *old* and *new* ML: "Boosting Black Box Variational Inference". Spotlight slides uploaded. Manuscript revision posted.

    3 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 8ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  18. ನವೆಂ 28

    New work on Sparse Binary Relation Representations for Genome Graph Annotations by et al. Compressing 2,652 RNA-seq read sets into 9.2GB (3.7B x 2,652 bit matrix compressed to 0.8% of uncompressed size).

    3 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 7ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  19. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ನವೆಂ 26

    A web of genomes - new article on by Andre Kahles, group of Gunnar Rätsch

    1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 3ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  20. ನವೆಂ 23

    Third round of attractive ETH CS Student Summer Research Fellowship. Please forward to outstanding students.

    1 reply 8 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 19ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು

@gxr ಅವರು ಇನ್ನೂ ಟ್ವೀಟ್ ಮಾಡಿಲ್ಲ.

ಲೋಡಿಂಗ್ ಸಮಯ ಸ್ವಲ್ಪ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತಿರುವಂತೆನಿಸುತ್ತದೆ.

Twitter ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಮೀರಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಕ್ಷಣಿಕವಾದ ತೊಂದರೆಯನ್ನು ಅನುಭವಿಸುತ್ತಿರಬಹುದು. ಮತ್ತೆ ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗೆ Twitter ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಭೇಟಿ ನೀಡಿ.

    ಇದನ್ನೂ ಸಹ ನೀವು ಇಷ್ಟಪಡಬಹುದು

    ·