| 1 | 48 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 94 | 79 | 143 | 27 |
| 2 | 82 | Kyoto University / 京都大学 | | 88 | 131 | 132 | 77 |
| 3 | 165 | Osaka University / 大阪大学 | | 270 | 306 | 242 | 113 |
| 4 | 214 | Tohoku University / 東北大学 | | 373 | 392 | 383 | 121 |
| 5 | 227 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 316 | 326 | 325 | 196 |
| 6 | 263 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 273 | 356 | 429 | 264 |
| 7 | 265 | Kyushu University / 九州大学 | | 437 | 385 | 384 | 246 |
| 8 | 277 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 430 | 204 | 657 | 388 |
| 9 | 286 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 551 | 450 | 280 | 245 |
| 10 | 324 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 411 | 344 | 744 | 341 |
| 11 | 376 | Hiroshima University / 広島大学 | | 404 | 509 | 512 | 407 |
| 12 | 438 | Kobe University / 神戸大学 | | 556 | 589 | 712 | 476 |
| 13 | 472 | Waseda University / 早稲田大学 | | 1803 | 582 | 552 | 485 |
| 14 | 575 | Okayama University / 岡山大学 | | 420 | 1293 | 582 | 497 |
| 15 | 624 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 1156 | 480 | 1054 | 906 |
| 16 | 666 | Chiba University / 千葉大学 | | 3125 | 1367 | 441 | 523 |
| 17 | 685 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 740 | 1202 | 1025 | 643 |
| 18 | 749 | (1) Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 2271 | 1234 | 700 | 753 |
| 19 | 760 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1192 | 1424 | 900 | 731 |
| 20 | 770 | Niigata University / 新潟大学 | | 963 | 1423 | 743 | 798 |
| 21 | 773 | Nihon University / 日本大学 | | 1137 | 893 | 1461 | 898 |
| 22 | 819 | Shinshu University / 信州大学 | | 1905 | 1617 | 1006 | 688 |
| 23 | 839 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1105 | 1333 | 1161 | 890 |
| 24 | 864 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 3658 | 1825 | 377 | 793 |
| 25 | 865 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 3679 | 1977 | 707 | 662 |
| 26 | 871 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 1150 | 796 | 1066 | 1386 |
| 27 | 882 | Yamagata University / 山形大学 | | 718 | 1276 | 1560 | 995 |
| 28 | 911 | Gunma University / 群馬大学 | | 1628 | 1280 | 1312 | 990 |
| 29 | 916 | Gifu University / 岐阜大学 | | 511 | 1770 | 1143 | 964 |
| 30 | 949 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1603 | 1856 | 1306 | 837 |
| 31 | 949 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1238 | 1328 | 1571 | 1029 |
| 32 | 959 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 2176 | 1643 | 1014 | 938 |
| 33 | 970 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1836 | 1889 | 1528 | 800 |
| 34 | 975 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 778 | 2017 | 644 | 1048 |
| 35 | 984 | Tokai University / 東海大学 | | 2214 | 1401 | 1749 | 950 |
| 36 | 989 | University of Toyama / 富山大学 | | 1517 | 1781 | 866 | 1012 |
| 37 | 991 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 2472 | 1454 | 1047 | 1053 |
| 38 | 1015 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2922 | 1743 | 991 | 960 |
| 39 | 1019 | United Nations University (国際連合大学) | | 996 | 342 | 834 | 2584 |
| 40 | 1031 | Mie University / 三重大学 | | 1345 | 1525 | 1169 | 1162 |
| 41 | 1041 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2386 | 1495 | 962 | 1153 |
| 42 | 1042 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1530 | 2151 | 1055 | 925 |
| 43 | 1048 | Ehime University / 愛媛大学 | | 2325 | 1661 | 1514 | 957 |
| 44 | 1065 | Doshisha University / 同志社大学 | | 792 | 1318 | 1015 | 1497 |
| 45 | 1114 | Saga University / 佐賀大学 | | 1714 | 1542 | 1797 | 1166 |
| 46 | 1120 | Meiji University / 明治大学 | | 837 | 1116 | 1273 | 1695 |
| 47 | 1138 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 2282 | 1948 | 796 | 1217 |
| 48 | 1169 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 2206 | 2901 | 914 | 878 |
| 49 | 1175 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1146 | 2078 | 1677 | 1111 |
| 50 | 1179 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 1463 | 1913 | 980 | 1339 |
| 51 | 1191 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 1974 | 2155 | 1070 | 1170 |
| 52 | 1228 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1260 | 1810 | 1580 | 1358 |
| 53 | 1237 | Kitasato University / 北里大学 | | 2586 | 2087 | 1963 | 1038 |
| 54 | 1245 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2795 | 2564 | 827 | 1119 |
| 55 | 1256 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 637 | 1860 | 1284 | 1580 |
| 56 | 1296 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 1451 | 1723 | 1985 | 1431 |
| 57 | 1302 | Hosei University / 法政大学 | | 1100 | 1153 | 1801 | 1934 |
| 58 | 1306 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2015 | 2065 | 1821 | 1296 |
| 59 | 1327 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 2414 | 3336 | 1376 | 938 |
| 60 | 1341 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 5772 | 3598 | 1024 | 827 |
| 61 | 1349 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2613 | 1981 | 1327 | 1501 |
| 62 | 1359 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2686 | 2358 | 1113 | 1392 |
| 63 | 1363 | Kochi University / 高知大学 | | 2613 | 2544 | 2385 | 1066 |
| 64 | 1364 | (1) Hiroshima Institute of Technology / 広島工業大学 | | 2856 | 1146 | 4759 | 1390 |
| 65 | 1384 | Kansai University / 関西大学 | | 1658 | 1983 | 1499 | 1625 |
| 66 | 1399 | Kagawa University / 香川大学 | | 2564 | 2722 | 1420 | 1289 |
| 67 | 1420 | Toho University / 東邦大学 | | 3679 | 2782 | 1836 | 1132 |
| 68 | 1424 | Chuo University / 中央大学 | | 2431 | 1619 | 1789 | 1772 |
| 69 | 1441 | Shimane University / 島根大学 | | 1105 | 2934 | 1166 | 1492 |
| 70 | 1441 | Tottori University / 鳥取大学 | | 1747 | 2975 | 1683 | 1286 |
| 71 | 1444 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 3851 | 2044 | 1536 | 1530 |
| 72 | 1498 | Iwate University / 岩手大学 | | 1539 | 2153 | 2078 | 1689 |
| 73 | 1501 | University of Fukui / 福井大学 | | 2472 | 3220 | 1151 | 1377 |
| 74 | 1523 | Teikyo University / 帝京大学 | | 3219 | 3266 | 2483 | 1077 |
| 75 | 1528 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 4837 | 4037 | 1040 | 1053 |
| 76 | 1533 | Rikkyo University / 立教大学 | | 1916 | 1704 | 3346 | 1747 |
| 77 | 1544 | University of Aizu / 会津大学 | | 1889 | 2552 | 1434 | 1715 |
| 78 | 1563 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2988 | 2169 | 1493 | 1827 |
| 79 | 1566 | Sophia University / 上智大学 | | 2325 | 1960 | 1366 | 2036 |
| 80 | 1569 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 3901 | 3763 | 1354 | 1184 |
| 81 | 1600 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 4489 | 2838 | 1761 | 1427 |
| 82 | 1623 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 6915 | 3313 | 1671 | 1227 |
| 83 | 1631 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 1623 | 2940 | 1754 | 1695 |
| 84 | 1640 | Toyo University / 東洋大学 | | 3871 | 1529 | 1917 | 2188 |
| 85 | 1655 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 3964 | 3908 | 1364 | 1312 |
| 86 | 1669 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 5053 | 2645 | 1776 | 1628 |
| 87 | 1671 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1633 | 2359 | 1784 | 2036 |
| 88 | 1679 | Akita University / 秋田大学 | | 2795 | 2812 | 2125 | 1659 |
| 89 | 1687 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 1355 | 2929 | 1623 | 1901 |
| 90 | 1690 | Kanagawa University / 神奈川大学 | | 2030 | 2506 | 2353 | 1854 |
| 91 | 1704 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 2109 | 4533 | 1877 | 1239 |
| 92 | 1725 | Chubu University / 中部大学 | | 4163 | 3214 | 1100 | 1760 |
| 93 | 1736 | Kyoto Sangyo University / 京都産業大学 | | 3011 | 2378 | 1627 | 2092 |
| 94 | 1743 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 6395 | 3779 | 2610 | 1184 |
| 95 | 1744 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 5791 | 4054 | 947 | 1484 |
| 96 | 1765 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 3966 | 3048 | 2833 | 1562 |
| 97 | 1781 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 5608 | 6108 | 1290 | 947 |
| 98 | 1806 | Hitotsubashi University / 一橋大学 | | 1416 | 1739 | 2339 | 2603 |
| 99 | 1815 | Shiga University of Medical Science / 滋賀医科大学 | | 3994 | 4219 | 2091 | 1360 |
| 100 | 1843 | Utsunomiya University / 宇都宮大学 | | 1706 | 3482 | 1744 | 1940 |
