Adam Phillippy

@aphillippy

Genome informatics for the advancement of global health. Open science, source, data. Investigator at NIH/NHGRI. Tweets are my own.

Maryland
genomeinformatics.github.io
ಜೂನ್ 2009 ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸೇರಿದ್ದಾರೆ

ಮಾಧ್ಯಮ

  1. ಡಿಸೆಂ 12

    Exploration of the cattle rumen microbiome with PacBio, Illumina, and Hi-C. Comparison of the techs and assignment of virus and antimicrobial resistance genes to microbial hosts. New work w/ Derek Bickhart &

    31 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 47ಇಷ್ಟಗಳು
  2. ನವೆಂ 14

    "Improved reference genome of Aedes aegypti informs arbovirus vector control" The project that put genome assembly to the front page of the is finally published! Loved working with et al. Link to paper: And a bonus pic of Ben Matthews :)

    1 reply 19 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 45ಇಷ್ಟಗಳು
  3. ನವೆಂ 9

    My academic brother introducing our shared (and exemplary) PhD advisor at

    25ಇಷ್ಟಗಳು
  4. ನವೆಂ 8

    kicking off

    1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 13ಇಷ್ಟಗಳು
  5. ಅಕ್ಟೋ 30

    Great idea from and to look at all past RefSeq versions and show how Kraken classifications depend heavily on the database. Our new paper:

    8 replies 89 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 142ಇಷ್ಟಗಳು
  6. ಅಕ್ಟೋ 22

    We thought 20 Mbp haplotigs were pretty incredible when we first wrote the trio binning paper. Since then, we've assembled 70 Mbp(!!) NG50 haplotigs for 's latest cross between a Highland bull and a yak

    1 reply 6 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 34ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
  7. ಅಕ್ಟೋ 22

    "De novo assembly of haplotype-resolved genomes with trio binning" now out in ! With Link:

    6 replies 83 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 153ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
  8. ಅಕ್ಟೋ 1

    Congrats to Dr. on his successful defense! 🎉

    3 replies 4 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 43ಇಷ್ಟಗಳು
  9. ಜುಲೈ 23

    Goldfish genome! "De Novo assembly of the goldfish (Carassius auratus) genome and the evolution of genes after whole genome duplication" from and co.

    2 replies 30 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 55ಇಷ್ಟಗಳು
  10. ಜುಲೈ 20

    Want to quickly map your long-read metagenome against all RefSeq and estimate sample composition? Our new preprint with shows you how: "MetaMaps - Strain-level metagenomic assignment and compositional estimation for long reads"

    6 replies 122 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 170ಇಷ್ಟಗಳು
  11. ಮೇ 21

    The human rDNA unit makes for a pretty dotplot. There are hundreds of these per genome and accurately assembling them is one of the last remaining challenges of the human genome. and now give us a fighting chance.

    2 replies 14 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 40ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
  12. ಮೇ 3
    ಅವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ

    1 reply 7ಇಷ್ಟಗಳು
  13. ಏಪ್ರಿ 20

    "RefSeq database growth influences the accuracy of k-mer-based species identification" A shame that didn't go with my suggested title "No, that's not actually anthrax on the subway, international space station, etc."

    8 replies 100 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 153ಇಷ್ಟಗಳು
  14. ಮಾರ್ಚ್ 9

    I'm not saying is wrong, I'm just saying if you look at all microbial genomes in RefSeq the difference in % frameshifted genes between PacBio and Illumina assemblies is quite small. IonTorrent on the other hand... (Plot via )

    6 replies 32 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 54ಇಷ್ಟಗಳು
  15. ಮಾರ್ಚ್ 3
    ಅವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ

    KAT is a great way to evaluate an assembly, and was very helpful for this project. The supplement is full of KAT plots, like this pretty one from an A. thaliana cross. Thank you an co!

    1 reply 17 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 19ಇಷ್ಟಗಳು
  16. ಫೆಬ್ರವರಿ 26

    "Complete assembly of parental haplotypes with trio binning" My favorite kind of method -- simple to explain, works brilliantly. et al. launch the

    2 replies 109 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 172ಇಷ್ಟಗಳು
  17. ಫೆಬ್ರವರಿ 6

    Fast approximate algorithms like MashMap let you do previously impractical things like an all-pairs comparison of every known microbial genome (e.g. also from )

    4 replies 63 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 89ಇಷ್ಟಗಳು
  18. ಫೆಬ್ರವರಿ 6

    Our latest with "A Fast Adaptive Algorithm for Computing Whole-Genome Homology Maps" () used to make this nifty image of all human repeats >85% identity (blue 1-5 kb, red 5-10 kb, black >10 kb)

    1 reply 56 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 109ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
  19. ಜನವರಿ 11
    ಅವರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ

    No joke. That's essentially what we did with and friends and it worked amazingly well. Tim wants to do a liger next ;)

    2 replies 3 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 4ಇಷ್ಟಗಳು
  20. ಡಿಸೆಂ 14,2017
    ಅವರು ಮತ್ತು

    Dimensions of a sequencing nanopore and 1 Mbp strand of DNA

    3 replies 55 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 85ಇಷ್ಟಗಳು

@aphillippy ಅವರು ಫೋಟೋ ಅಥವಾ ವಿಡಿಯೋಗಳಿರುವ ಯಾವುದೇ ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳನ್ನು ಕಳಿಸಿಲ್ಲ.

ಲೋಡಿಂಗ್ ಸಮಯ ಸ್ವಲ್ಪ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತಿರುವಂತೆನಿಸುತ್ತದೆ.

Twitter ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಮೀರಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಕ್ಷಣಿಕವಾದ ತೊಂದರೆಯನ್ನು ಅನುಭವಿಸುತ್ತಿರಬಹುದು. ಮತ್ತೆ ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗೆ Twitter ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಭೇಟಿ ನೀಡಿ.

    ಇದನ್ನೂ ಸಹ ನೀವು ಇಷ್ಟಪಡಬಹುದು

    ·