Hasindu Gamaarachchi

@Hasindu2008

Computer Engineering PhD student at the embedded systems lab, UNSW - Designing embedded systems for bioinformatics applications.

Sydney, New South Wales
linkedin.com/in/hasindugama…
ಮೇ 2012 ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸೇರಿದ್ದಾರೆ
10 ಫೋಟೋಗಳು ಅಥವಾ ವೀಡಿಯೋಗಳು ಫೋಟೋಗಳು ಮತ್ತು ವೀಡಿಯೋಗಳು

ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳು

ನೀವು @Hasindu2008 ಅವರನ್ನು ತಡೆಹಿಡಿದಿರುವಿರಿ

ಈ ಟ್ವೀಟ್‌ಗಳನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು ನೀವು ಖಚಿತವಾಗಿ ಬಯಸುವಿರಾ? ಟ್ವೀಟ್ ವೀಕ್ಷಣೆಯು @Hasindu2008 ಅವರ ತಡೆತೆರವುಗೊಳಿಸುವುದಿಲ್ಲ

  1. ಡಿಸೆಂ 12

    Our current GPU accelerated Suzuki's adaptive banded DP alignment algorithm in the context of event-level alignment in . Around 2X improvement overall. Having said that the first version was 100X slower.

    2 replies 8 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 19ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  2. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಅಕ್ಟೋ 23

    Interested in a long-read assembler with the speed of miniasm and comparable consensus accuracy of canu? Try wtdbg2 by my friend Jue Ruan. A human genome in one day. Also available from bioconda.

    9 replies 211 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 342ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  3. ಅಕ್ಟೋ 15

    Never imagined that the malloc in glibc affects the multithreaded performance by this much! :o Impact of malloc on call-methylation performance ...

    3 replies 12 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 29ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  4. ಸೆಪ್ಟೆಂ 21

    Now our cluster with processors can "reliably" perform + call-methylation for 8 Gbase minION flow cell data in around 6.5 hours. Now the PromethION time. the NAS is now doing good !!

    2 replies 20 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 38ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  5. ಅವರು ಮರುಟ್ವೀಟಿಸಿದ್ದಾರೆ
    ಆಗ 8

    Our new preprint describes how the latest minimap2 release can run with ridiculously low amounts of RAM: <2GB for human genome alignments.

    minimap2-2.12 released with better multi-part index support and more mappy features. Available via bioconda, pypi and the release page:
    1 reply 35 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 74ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  6. ಜುಲೈ 8

    Week end fun : Ecoli consensus and chr22 methylation detection using on my mobile phone for some reads (Includes minimap2 and samtools).

    2 replies 14 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 29ಇಷ್ಟಗಳು
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  7. ಜೂನ್ 29

    And here it takes 70 minutes for 70M bases with base level alignment.

    2 replies 1 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆ 5ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು
  8. ಜೂನ್ 29

    Running minimap2 for GRCh38 on my mobile phone

    6 replies 34 ಮರುಟ್ವೀಟಿಸುವಿಕೆಗಳು 96ಇಷ್ಟಗಳು
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ಈ ಥ್ರೆಡ್ ತೋರಿಸಿ
    ರದ್ದುಗೊಳಿಸು

@Hasindu2008 ಅವರು ಇನ್ನೂ ಟ್ವೀಟ್ ಮಾಡಿಲ್ಲ.

ಲೋಡಿಂಗ್ ಸಮಯ ಸ್ವಲ್ಪ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತಿರುವಂತೆನಿಸುತ್ತದೆ.

Twitter ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಮೀರಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಕ್ಷಣಿಕವಾದ ತೊಂದರೆಯನ್ನು ಅನುಭವಿಸುತ್ತಿರಬಹುದು. ಮತ್ತೆ ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗೆ Twitter ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಭೇಟಿ ನೀಡಿ.

    ಇದನ್ನೂ ಸಹ ನೀವು ಇಷ್ಟಪಡಬಹುದು

    ·